民國71年新竹縣、市改制，78年縣市稅捐稽徵處分署辦公，本局前身為新竹市稅捐稽徵處，97年7月配合「地方制度法」及「新竹市政府組織自治條例暨編製表」修正，更名為新竹市稅務局，負責新竹市(面積104平方公里，人口402,368人) 房屋稅、地價稅、使用牌照稅、土地增值稅、娛樂稅、印花稅、契稅、田賦（目前停徵）等地方稅稽徵工作。

本局設有11個科3個室，各科業務執掌如下：